Dolda flöden är en berättelse från Bergslagen, idag en region lämnad i medieskugga och smygande förödelse. I centrum finns nedlagda lokalredaktionen i Smedjebacken. Erfarna murveln Kerstin Lindgren ser sig alltjämt som traktens publicistiska hjärta och håller öppet som vanligt. När unge doktoranden Benjamin Tabaro flyttar in hos Kerstin börjar hon processa sin egen gärning: hon har aldrig på djupet insett hotet från de enorma lager av arsenik och bly som Statsgruvor lämnat efter sig. Tusentals ton avfallssand, som fortsätter läcka ut i vattensystemen. Parallellt med den tickande miljökatastrofen finns planer på att förvandla trakten till attraktivt turistmål. Projektledaren, Francesca Morejo-Stridh, har svårt att bortse från bristerna i det EU-finansierade tilltaget. En underfundig, ögonöppnande samhällsskildring om livet utanför storstäderna.